机关分党委所辖22个党支部，具体如下：

1、中国共产党山东交通学院办公室支部委员会

2、中国共产党山东交通学院纪检支部委员会

3、中国共产党山东交通学院组织部支部委员会

4、中国共产党山东交通学院宣传部支部委员会

5、中国共产党山东交通学院学生工作部支部委员会

6、中国共产党山东交通学院发展规划与学科建设支部

7、中国共产党山东交通学院人力资源处支部委员会

8、中国共产党山东交通学院教务处支部委员会

9、中国共产党山东交通学院科研处支部委员会

10、中国共产党山东交通学院研究生工作部支部

11、中国共产党山东交通学院招生就业处支部委员会

12、中国共产党山东交通学院财务处支部委员会

13、中国共产党山东交通学院审计处支部

14、中国共产党山东交通学院国际合作交流处支部

15、中国共产党山东交通学院资产管理处支部委员会

16、中国共产党山东交通学院安全管理处支部委员会

17、中国共产党山东交通学院产教融合办公室支部委员会

18、中国共产党山东交通学院工会支部

19、中国共产党山东交通学院团委支部

20、中国共产党山东交通学院图书馆支部委员会

21、中国共产党山东交通学院信息化建设与管理办公室支部

22、中国共产党山东交通学院学报编辑部支部